O CNRS é o parceiro responsável pela implementação, acompanhamento e bom funcionamento do projeto, pela entrega dos relatórios ao STC e pela gestão administrativa e financeira. A governança do projeto é realizada através de um órgão de decisão, o Comité Diretivo (CD), um órgão técnico, o Comité Técnico (CT) e um órgão consultivo, o Comité Consultivo (CC). O CD é composto pelos parceiros responsáveis de cada instituição. O CT é formado por todos os parceiros do projecto. O CC é constituído pelos parceiros do projecto e parceiros associados, estando aberto a todos os potenciais parceiros e agentes socioeconómicos ligados à gestão dos recursos hídricos no território SUDOE. O CD e CT reúnem-se a cada 6 meses para rever o estado do projecto e definir as acções a realizar nos meses seguintes. O CC reúne-se uma vez por ano. O chefe do projeto será o único contacto com o INTERREG-SUDOE, em representação do consórcio, sendo responsável por assegurar a consistência financeira do projecto e garantir o desenvolvimento dos produtos e a sua entrega nas datas acordadas com o INTERREG-SUDOE. A cada 6 meses será organizada uma reunião onde serão tratadas as questões relacionadas com a gestão financeira do projecto, em termos de execução das despesas e cumprimento do cronograma. O CD, que representa todos os parceiros, é o responsável pelo cumprimento do cronograma do projecto.